I giocatori che giocano con "EteRNA" battono la scienza professionale in questa scoperta cruciale

La scienza dei cittadini è andata al livello successivo: i videogiocatori hanno fatto una scoperta biologica ed è stata pubblicata da una rivista scientifica sottoposta a peer review.

Pubblicato questa settimana nel Journal of Molecular Biology, una serie di regole intuitivamente sviluppate per la difficile realizzazione di una particolare forma attraverso la progettazione di RNA. Hanno trovato, ad esempio, che più una forma è simmetrica, più difficile sarà progettare un filamento di RNA per abbinarlo.

Il collettivo di videogiocatori ha fatto la scoperta giocando, ETERNA, un gioco che sfida i giocatori a prendere fili di RNA e piegarli in una forma desiderata alterando il loro trucco chimico. Il problema scientifico di piegare l'RNA in una particolare forma è complesso, ma il gioco non lo è: non è richiesta alcuna comprensione della biochimica per iniziare a giocare.

I giocatori hanno raccolto la domanda di ricerca di propria iniziativa, come un modo per dare ai nuovi giocatori strumenti per giudicare la relativa difficoltà di diversi enigmi. I risultati aiuteranno a guidare la futura ricerca biomedica, poiché il nuovo set di regole dà agli scienziati una migliore percezione se tentare o meno di piegare l'RNA in una data forma è un esercizio inutile.

"Questa ricerca suggerisce che il paradigma standard del crowdsourcing scientifico può essere capovolto", dice Rhiju Das, professore di biochimica a Stanford, Inverso in una email ETERNA è stato lanciato nel 2011 da Das e Adrien Treuille, un assistente professore di informatica presso la Carnegie Mellon University. “ ETERNA i giocatori possono escogitare le proprie domande di ricerca e possono scrivere i propri documenti. In questa ricerca, c'erano un po 'di guida e test indipendenti da parte di esperti nel mio laboratorio."

L'RNA sintetizzato ha un incredibile potenziale per una nuova generazione di farmaci e terapie mediche. Se può essere piegato nella giusta forma, l'RNA può essere costruito per colpire specifici virus, tumori e persino disordini genetici. CRISPR, un processo di modifica genica che potrebbe alterare drammaticamente il futuro dell'esistenza umana, utilizza l'RNA per guidare l'enzima di taglio del DNA, Cas9, nella sezione indesiderabile del DNA.

ETERNA è iniziato come un forum per scienziati esperti per presentare puzzle ai giocatori, ma da allora è cresciuto oltre. Il gioco e i suoi 100.000 giocatori registrati ora esistono in una relazione simbiotica e in continua evoluzione con scienziati professionisti e modelli di computer costruiti per progettare e testare la struttura dell'RNA.

"Modellazione di computer e ETERNA non sono esclusivi ", afferma Das. “ ETERNA riunisce molte persone, alcune delle quali stanno scrivendo i propri modelli di computer ".

Nel documento attuale, i giocatori hanno scritto in modo collaborativo script per testare le loro idee su ciò che rende le strutture dell'RNA difficili da progettare. Das dice che alcuni giocatori gli hanno detto che sono particolarmente entusiasti di automatizzare le loro idee in modelli di computer perché vogliono andare avanti e risolvere problemi più difficili.

Problemi costruiti da ETERNA i giocatori in realtà vengono sintetizzati nel laboratorio di Das: finora sono stati costruiti 86.459 sequenze generate dai giocatori.

Gli autori principali del documento erano ETERNA i giocatori Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju e Michelle Wu. Wu è anche un dottorato di ricerca. studente in informatica biomedica a Stanford.

In futuro, potrebbe essere che gli esperti cittadini inizino a pubblicare le scoperte scientifiche in modo completamente indipendente.

"Questo modello di" crowdsourcing "capovolto per la scienza dei cittadini potrebbe essere utile per altri progetti e campi scientifici, come l'astronomia (Galaxy Zoo) o identificazione di specie di provenienza folle (Barcode of Life), "Dice Das. "Soprattutto se loro, come ETERNA, stanno vedendo i colli di bottiglia nella fase di scrittura della carta."