E' UFFICIALE: ESTINTO PER SEMPRE IL RINOCERONTE NERO
Il 21 ° secolo è un momento fantastico per essere un bioingegnere e un tempo orribile per essere un rinoceronte nero. La specie africana, che contava 850.000 un secolo fa, è stata ridotta a una popolazione in rapida diminuzione di circa 5.000. Nelle speranze di un giorno di riavvolgere questo catastrofico declino, i biologi stanno cercando di attirare in crowdsour il sequenziamento del diceros bicornis bicornis genoma.
Il progetto è uno sforzo collaborativo tra diversi esperti di biotecnologie conservatrici, tra cui il patologo e bioingegnere dell'Università di Washington, Charles Murray e Matthew Markus, CEO di Pembient. Pembient è una società di biotecnologie di San Francisco che vuole invadere i mercati cinesi con corno di rinoceronte sintetico, ma biologicamente identico, stampato in 3D da cheratina prodotta in laboratorio e forse consegnato come birra al rinoceronte. (La cheratina è la sostanza di cui sono fatte le unghie e le corna di rinoceronte. Non è né magico né medicinale.) Pembient potrebbe imparare abbastanza dal genoma di un singolo rinoceronte chiamato Ntombi, ha detto Markus Inverso, per perfezionare il modo in cui sintetizza le proteine del rinoceronte.
Ma prima che chiunque possa estrarre la genetica di Ntombi per i dati, il genoma del rinoceronte nero deve essere prima sequenziato. Il progetto è circa a metà strada per raccogliere $ 16,500 su Experiment.com, una piattaforma di crowdfunding come Kickstarter fatta eccezione per la scienza invece di resuscitare videogiochi morti da tempo.
"Ci sono ancora relativamente pochi organismi i cui genomi sono stati sequenziati", dice Murray. "Fino a poco tempo fa questo era molto difficile - tempo e costoso".
Questo non vuol dire che gli animali non stanno facendo fare il genoma. Il progetto Genome 10K mira a raccogliere un'arca di dati genetici di Noè. E il rinoceronte bianco del sud, una specie più popolosa e più grande, ha avuto il sequenziamento del suo genoma nel 2012. Ma che dire dei rinoceronti neri come Ntombi? "Non è chiaro perché il rinoceronte nero sia stato lasciato a lato per così tanto tempo", dice Markus. Getta l'omissione fino alla coincidenza; ma potrebbe essere che, poiché i bianchi del sud erano già stati sequenziati, il rinoceronte nero non era stato una priorità.
Markus, Murray e i loro collaboratori mirano a colmare questa lacuna. Ntombi, il rinoceronte del progetto, ha già avuto il sangue disegnato e conservato - e, bingo! DNA del rinoceronte. Il sequenziamento dovrebbe essere abbastanza semplice, ha detto Murray. "È di grande aiuto avere il genoma del rinoceronte bianco come punto di riferimento".
I prossimi passi nella sequenza
Con il DNA di Ntombi ospitato sui server di DNAnexsus, i biologi avranno gettato le basi per la genomica del rinoceronte comparativa. "Una volta ottenuta la sequenza, possiamo iniziare a capire che cosa rende un rinoceronte un rinoceronte, come il bianco differisce dal nero", afferma Murray, "e fornire informazioni che consentano di tracciare campioni in camicia".
I veterinari potrebbero verificare la presenza di geni potenzialmente patogeni e avere una base di riferimento per confrontare le altre sette sottospecie di rinoceronte nero, tre delle quali sono già estinte.
Gli animali dopo domani
Una volta che avremo una più solida comprensione della genetica del rinoceronte nero, si apriranno diverse porte teoriche. "Lungo la strada sono entusiasta dell'utilizzo di cellule staminali per capire la fisiologia del rinoceronte e, potenzialmente, per far crescere le corna di rinoceronte in laboratorio per ridurre il bracconaggio", afferma Murray.
Markus prognostica un po 'oltre. Per diceros bicornis bicornis Markus non immagina tanta estinzione di stile mastodontico, ma riavvolge l'orologio genetico; più le popolazioni più piccole diventano, più sono inclini a problemi ereditati.
E per i rinoceronti neri che sono spariti? Egli confronta questo sforzo con quello del sequenziamento del genoma del rinoceronte bianco settentrionale, un progetto in corso allo zoo di San Diego. Si parla di cercare di ottenere un rinoceronte bianco del sud (di cui ci sono 20.000) per portare un rinoceronte bianco settentrionale (di cui ci sono 5) a termine. Markus parla con cauto, attento ottimismo: "Potenzialmente - potenzialmente - forse la sottospecie di rinoceronte nero estinto potrebbe essere riportata in vita".
Evoluzione dell'influenza: come gli scienziati utilizzano il sequenziamento del genoma per prevedere il futuro
L'evoluzione è di solito molto lenta, ma per l'influenza è veloce e mortale. Ogni pochi anni emergono nuove varianti dell'influenza che causano epidemie in tutto il mondo. Ecco perché gli scienziati stanno controllando la diffusione dell'influenza utilizzando il sequenziamento del genoma per prevedere come cambierà il virus.
Il sequenziamento del genoma rivela che Colombo non ha cancellato gli abitanti dei Caraibi
Un nuovo studio rivela che il Taíno, una popolazione caraibica indigena, non è stato completamente spazzato via dopo l'arrivo di Cristoforo Colombo nella loro isola.
La nuova scoperta del sequenziamento del genoma antico rivela il quarto filone della stirpe europea
Circa 25.000 anni fa una popolazione di cacciatori-raccoglitori estese un periodo dell'era glaciale isolato nelle caverne dove la Russia meridionale incontra la Georgia: la regione del Caucaso. Erano arrivati circa 20.000 anni prima, dopo essersi separati da altri del loro genere che si erano trasferiti verso l'alto e verso ovest dopo la migrazione dall'Africa. Il...